Pendiente de que el resto de participantes opine, la idea más práctica parece:
Hacer capítulos muy sencillos y muy cortos. Con todos los subcapítulos que haga falta, en página aparte (es decir: para cada panel de control, un subcapítulol).
En cuanto a la organización, propongo:
Ejemplo práctico de lo que quiero decir: el boceto de Time Machine.
Añado: en cada "capítulo" debería haber un listado de links a sus subcapítulos para facilitar la navegación, me parece.